<div dir="ltr">FYI, this is open to all. See the announcement below and in this <a href="https://github.com/ioos/marine_life_data_network/discussions/147" target="_blank">GitHub discussion</a>.<br><br><div class="gmail_quote gmail_quote_container"><div dir="ltr" class="gmail_attr">---------- Forwarded message ---------<br>From: <strong class="gmail_sendername" dir="auto">Mathew Biddle - NOAA Federal</strong> <span dir="auto"><<a href="mailto:mathew.biddle@noaa.gov">mathew.biddle@noaa.gov</a>></span><br>Date: Mon, Jul 7, 2025 at 10:00 AM<br>Subject: Marine Life Data Workshop for July 8th at 1pm ET: edna2obis: mobilizing eDNA data to Darwin Core (Guest: Katherine Silliman, Bayden Willms)<br></div><br><br><div dir="ltr"><div><div>Hi MBON DMAC'ers! </div><div><br></div><div>Our next "data session" will be held on July 8th from 1pm ET - 3pm ET. The topic will be " edna2obis: mobilizing eDNA data to Darwin Core " and will be hosted by Katherine Silliman, Bayden Willms, and Luke Thompson. This is a follow on to the April 8th session on <a href="https://fair-edna.github.io/index.html" target="_blank">FAIR-eDNA</a> and <a href="https://github.com/BeBOP-OBON" target="_blank">BeBOP</a> (notes <a href="https://docs.google.com/document/d/1eaGBKaJU3TicqyXY5QLBd-qaH1cQuPGoTJi1NWU9NXs/edit?tab=t.0#heading=h.2hdqhz31vf5w" target="_blank">here</a>). Below is the connection information if you would like to attend as well as an overview of the session.<br><br>The meeting is open to others who might have an interest as well.</div><div><br></div><div>DNA derived data are increasingly being used to document taxon occurrences. To ensure these data are useful to the broadest possible community, <a href="https://www.gbif.org/" target="_blank">GBIF</a> published a guide entitled "<a href="https://docs.gbif.org/publishing-dna-derived-data/en/" target="_blank">Publishing DNA-derived data through biodiversity data platforms.</a>" This guide is supported by the <a href="https://tools.gbif.org/dwca-validator/extension.do?id=http://rs.gbif.org/terms/1.0/DNADerivedData" target="_blank">DNA derived data extension</a> for <a href="https://dwc.tdwg.org/" target="_blank">Darwin Core</a>, which incorporates <a href="https://gensc.org/mixs/" target="_blank">MIxS</a> terms into the Darwin Core standard.<br><br>This use case draws on both the guide and the extension to develop a workflow (<a href="https://github.com/aomlomics/edna2obis" target="_blank">edna2obis</a>) for incorporating a DNA derived data extension file into a Darwin Core archive.</div><div><br></div><div>Connection information:</div><div>MBON DMAC working group<br>Tuesday, July 8 · 1:00 – 2:50pm<br>Time zone: America/New_York<br>Google Meet joining info<br>Video call link: <a href="https://meet.google.com/imf-qrhy-jgx" target="_blank">https://meet.google.com/imf-qrhy-jgx</a><br>Or dial: ‪(US) +1 321-351-6755‬ PIN: ‪548 540 777‬#<br>More phone numbers: <a href="https://tel.meet/imf-qrhy-jgx?pin=2704290817714" target="_blank">https://tel.meet/imf-qrhy-jgx?pin=2704290817714</a></div><div><br></div><div>Featured tools:</div><div><ul><li style="margin-left:15px">bash shell</li><li style="margin-left:15px">python</li><li style="margin-left:15px">pyworms</li><li style="margin-left:15px">pandas</li><li style="margin-left:15px">biopython</li><li style="margin-left:15px">openpyxl</li></ul></div><div><br></div><div>Notes: <a href="https://docs.google.com/document/d/1eaGBKaJU3TicqyXY5QLBd-qaH1cQuPGoTJi1NWU9NXs/edit?tab=t.0#heading=h.q7rg8x9dl480" target="_blank">https://docs.google.com/document/d/1eaGBKaJU3TicqyXY5QLBd-qaH1cQuPGoTJi1NWU9NXs/edit?tab=t.0#heading=h.q7rg8x9dl480</a></div></div><div><br></div><div>Thanks,</div><div><br></div><div>Matt & Laura</div><div><br></div><div>P.S. You can follow our workshop announcements by following the Marine Life Data Network DataWorkshop discussions at <a href="https://github.com/ioos/marine_life_data_network/discussions/categories/dataworkshop" target="_blank">this link</a>.</div><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><font color="#999999">Mathew Biddle, Physical Scientist<br>NOAA/NOS<br>US Integrated Ocean Observing System Office<br>1315 East-West Highway<br>Silver Spring MD 20910</font><div><font color="#999999">240-533-9470<br></font><br><font color="#999999">ORCiD:</font> <a href="https://orcid.org/0000-0003-4897-1669" target="_blank">0000-0003-4897-1669</a><br><div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><a href="http://www.ioos.noaa.gov/" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">http://www.ioos.noaa.gov/</a></div></div></div></div></div></div>
</div><div><br clear="all"></div><div><br></div><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><font color="#999999">Mathew Biddle, Physical Scientist<br>NOAA/NOS<br>US Integrated Ocean Observing System Office<br>1315 East-West Highway<br>Silver Spring MD 20910</font><div><font color="#999999">240-533-9470<br></font><br><font color="#999999">ORCiD:</font> <a href="https://orcid.org/0000-0003-4897-1669" target="_blank">0000-0003-4897-1669</a><br><div><div style="color:rgb(136,136,136);font-size:12.8px"><a href="http://www.ioos.noaa.gov/" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">http://www.ioos.noaa.gov/</a></div></div></div></div></div></div>